Pada tahun 1986, model Toyota Kijang generasi III dilempar ke pasaran. Kijang generasi ini bentuknya lebih melengkung pada lekukannya sehingga kelihatan lebih moden. Model ini hingga saat ini masih banyak digunakan di jalanan di Indonesia meski tidak lagi dihasilkan.

Pada generasi ini, konsep Kijang sebagai kenderaan angkut mula beralih sebagai kenderaan penumpang sekalipun banyak Kijang generasi sebelumnya juga diubahsuai sebagai kenderaan penumpang. Pada generasi ini juga masih terdapat varian pick up, meski tidak lagi menjadi konsep utama Toyota Kijang seperti generasi sebelumnya. Di zaman / masa ini, boleh dikatakan sebagai generasi kejayaan Kijang sebagai kereta penumpang, terutama sebelum banyak kereta penumpang Built Up import meramaikan pasaran kenderaan di Indonesia serta puncak dominasi Toyota atas model-model kuat seperti Mitsubishi Colt L300 dan bas mini tanpa bonnet lain seperti Suzuki Carry dan Daihatsu Zebra dimana Kijang menjadi pilihan kuat konsumen saat itu. Toyota mengeluarkan dua jenis Kijang pada generasi ini yakni jenis Super Kijang dan Grand Extra dengan mempunyai life cycle cukup panjang (lebih dari satu dekad) berbanding generasi sebelumnya.

Reka bentuk kereta ini mempunyai bentuk lebih manis dan halus berbanding generasi lalu yang kaku mirip kotak sabun. Teknologi full pressed body diperkenalkan untuk menekan penggunaan dempul dalam proses pembuatannya hingga 2-5 kg dempul per kereta. Mesin pada awal generasi ini masih memakai jenis 5K namun mempunyai kuasa kuda (horse power) yang lebih tinggi yakni 63 hp dari sebelumnya 61 hp. Penghantaran menghadirkan 5 percepatan, dan 4 percepatan, yang sebelum ini hanya memakai 4 percepatan. Pada generasi ketiga ini, Toyota Kijang mempunyai varian yang cukup luas. Varian 'Komando' , dan 'Ranger' . varian 'Comando' sebagai ciri Toyota kijang ini mempunyai '4 pintu' dengan plihan:

• 'Comando' LSX (Kf50: 5 speed, Brek cakera depan).
• 'Comando' SSX (KF40: 5 speed, Brek cakera depan).
• 'Comando' LX (KF50: 4 speed).
• 'Comando' SX (KF40: 4 speed).

Ada pula Varian "Ranger" yang mempunyai ciri mempunyai '3 pintu' dengan kod casis 'KF40', dan mempunyai sistem percepatan 5speed (SSX), serta menggunakan sistem berhenti laju brek cakera pada bahagian depan. Varian 3 pintu ini sangat jarang ditemui, kerana dihasilkan hanya selama 3 tahun, antara 1987 hingga 1990.

Pelancaran logo baru Toyota pada November 1989, yang menjadi ciri khas kereta Toyota sampai saat ini. Seterusnya pada tahun 1991, Super Kijang mengalami perubahan pada sistem kemudi 'Rack & pinion' agar sistem kemudi lebih ringan, dan penyempurnaan pada Axle 3 kople untuk mengurangkan getaran. Serta penambahan power steering.

Selepas Ogos 1992, Toyota memasuki generasi perbaikan bodi mobil yang disebut sebagai Toyota Original Body. Sebuah proses pembuatan badan kereta dengan mesin press dan kaedah las titik. Sampai saat ini, boleh dikatakan satu-satunya Kijang yang bebas dempul. Pada masa ini berlaku perubahan letak tangki petrol yang awalnya berada di bawah bumper belakang menjadi di tengah samping kiri, sedangkan kedudukan tayar ganti yang semula diletakan di tengah samping kiri dipindah menjadi di bawah bumper belakang.

Manakala untuk versi Deluxe (Super G) terdapat perubahan khususnya pada lampu depan, grill, dan ditambah power steering pada kemudi yang meringankan pemandu. versi Grand Extra (sebagai Varian Tertinggi) mempunyai ciri penamaan LGX (Long Grand Xtra) SGX (Short Grand Xtra) terdapat penambahan tachometer, penambahan fender, Power Window, Alloy Wheel berjenama Enkei, dan AC double blower.

Pada tahun 1994 terdapat penambahan variasi enjin iaitu jenis 7K berkapasiti 1800 cc (naik 300 cc) yang lebih bertenaga, serta diberhentikan pengeluarannya varian enjin 5k pada tahun yang sama juga.

Selain itu, Toyota Kijang generasi ketiga juga menyediakan banyak rentang varian seperti: LX, LSX, LGX (untuk casis panjang) SX, SSX, SGX (untuk casis pendek), khusus LX, SX (Kijang Standard) dan pick up penghantaran menggunakan 4 percepatan dan menggunakan papan pemuka konvensional ala Super Kijang, serta penghenti laju rem tromol.

Selain jenis-jenis tersebut diatas juga terdapat beberapa jenis buatan karoseri tempatan, iaitu Rover (berubah menjadi RoverAce selepas mendapat bantahan dari pengeluar kereta Rover, Inggeris), Jantan (Roda Nada Karya), dan Toyota Kencana. Penceroboh dan Jantan kebanyakan menggunakan casis panjang, Rover casis pendek, dan Toyota Kencana mempunyai bumbung yang lebih tinggi dibanding Kijang biasanya.

Toyota Kijang Soeharto Series

Pada menjelang akhir-akhir Toyota Kijang ketiga, kira-kira tahun 1995-1996, varian Toyota Kijang Soeharto Series dilancarkan dalam rangka memperingati 50 Tahun Kemerdekaan Indonesia, 17 Ogos 1995. Bentuknya masih sama dengan varian Grand Extra. Hanya yang membezakan dengan siri biasa adalah siri ini adalah siri pertama Toyota Kijang yang menggunakan transmisi automatik 4 percepatan. Variasi ini juga dibangunkan untuk merayakan 75 Tahun Pak Harto (1921-1996) dengan nama Toyota Kijang Soeharto Series II. Penamaan siri Soeharto ini dikarenakan Soeharto juga ikut andil dalam melancarkan Toyota Kijang pada tahun 1975. Harganya bahkan lebih mahal dari siri biasa, bahkan mencapai Rp 100 juta / unit. Walaupun permintaan akan seri ini cukup tinggi, tetapi saat ini siri Toyota Kijang ini jarang berlaku kerana hanya dihasilkan dari tahun 1995-1996. Dengan dilancarkannya Toyota Kijang ini, makin mengukuhkan namanya menjadi kenderaan niaga buatan rakyat Indonesia untuk masyarakat Indonesia.